月经来的第三天同房不会怀孕，因为月经期不会有卵泡发育及排卵，再就是子宫内膜处于脱落期间，也不适合受精卵着床，所以不会导致怀孕。但是月经期子宫内膜脱落期间，子宫内膜有创伤面，所以这时同房，会导致感染，引起宫腔炎的情况，还可能导致经血逆流，形成子宫内膜异位的情况。