药物流产的时间可以在停经七周之内，也就是49天之内，但是药物流产最佳的时间是在40天左右。之所以选择在这个时间，是因为当时间太早，胚胎比较小，通过B超检查没有办法看到妊娠囊，没有办法判断是否为宫内妊娠，这个时候就不适合做药物流产。而如果时间太晚，妊娠囊比较大，发生流产不全、药流失败的风险也会有所升高。所以说49天之内都可以进行药物流产，但在怀孕40天左右进行会更加合适。