在药物流产后36天一直都不能干净，应该尽快的到医院做复查，有可能是子宫内有残留物或者恢复不良导致的。但是出血时间长的危害是比较大的，特别容易导致贫血，腹痛，子宫内的感染，或者出现严重的并发症，影响到以后的生育能力，建议尽快的做治疗。