子宫颈腺囊肿绝大多数情况下是子宫颈的生理性变化，子宫颈转化区鳞状上皮取代柱状上皮过程中，新生的鳞状上皮覆盖子宫颈腺管口或伸入腺管将腺管堵塞，导致腺体分泌物引流受阻，潴留形成囊肿。另外，子宫颈局部损伤或者慢性炎症使腺管狭窄也可导致子宫颈腺囊肿形成。如果没有症状可以观察观察看看，不需要特殊处理。