免疫功能正常人感染肺孢子菌多无明显的临床上的表现或仅有轻微的临床症状。新生儿在出生后数月内可感染肺孢子菌，但几乎不会引起新生儿严重感染及死亡。艾滋病患者合并肺孢子菌肺炎的早期典型临床上的表现包括发热、干咳、突发性低氧血症和呼吸急促等。常快速发展为呼吸衰竭。

小儿孢子虫肺炎的主要症状就是会有咳嗽咳痰，呼吸困难，发烧，胃口减退，有的还会有高热惊厥出现。这个可以是去医院肺部拍片还有血常规检查明确的。根据检查结果选择口服抗生素或者是输液治疗的，还有可以配合使用雾化吸入治疗。一般都是可以彻底治愈的疾病。