对于脑脓肿的患者来说，一般可以先通过药物保守治疗，选取容易透过血脑屏障的抗生素来进行治疗。同时注意动态复查头颅CT。如果头颅CT显示脑内的脓肿形成脓腔，并且做有效的包裹，可以后期考虑做脑脓肿穿刺，配合大剂量抗生素药物治疗，注意观察病情的变化。

脑脓肿是比较严重的疾病，需要手术引流脓液，同时需要把脓液送去培养，根据培养的结果选择敏感的抗生素消炎治疗。如果对于药物敏感的话，那还是可以彻底的治愈的。部分患者会有引起继发性癫痫或者是智力下降，记忆力下降的后遗症的。