新型冠状病毒病人的确诊需要明确的基因检测结果，也就是说对于临床上表现有发热、咳嗽、胸闷、气短，而且胸部CT等影像学检查肺部有病变的病人进行痰、咽拭子、呼吸道分泌物等检测的时候，病毒核酸阳性，或病毒基因组测序，与已知的新型冠状病毒高度同源就可以确诊。另外，新型冠状病毒的诊断还要与流感病毒、副流感病毒、腺病毒、呼吸道合胞病毒、鼻病毒、人偏肺病毒、SARS、MERS病毒等其他已知病毒性肺炎鉴别，与肺炎支原体、衣原体肺炎及细菌性肺炎等鉴别。