异基因造血干细胞移植可重建患者的造血系统和免疫系统而可能治愈本病。治愈之后能够达到正常人期望的寿命，一般不会复发。年龄小于四十岁，有HLA相合同胞供者的重型或极重型AA患者，首选HLA相合同胞供者的骨髓移植治疗。在移植前，应尽量避免输血。