可用于不明原因咯血、不明原因慢性咳嗽、支气管结核、良恶性肿瘤、异物吸入等诊断。它具有重要的价值。此外，纤维支气管镜有助于发现不明原因局部喘息的气道狭窄的位置和性质。肺癌术前检查可指导手术范围和估计预后。评价创伤中是否存在气管支气管内损伤或骨折。肺部感染性疾病的病因诊断是培养支气管肺泡灌洗液。