下降性小肠炎的治疗首先要戒烟戒酒，防止使用损害小肠黏膜的抗生素如抗生素、止痛痛、红霉素等，饮食宜规律性，防止过热、过咸和辛辣食物，积极主动治疗慢性口、鼻、咽部病毒感染病灶。病人小肠酸减少或缺乏，小肠内细菌孽生，尤其是幽门螺菌检出阳性率很高，应行抗幽门螺菌治疗，不同医院治疗方式并不会差别很大。