胃酸反流的典型症状为反酸、下颚后烧心感及下颚后痉挛。症状多在饱食之后或睡眠期间发生。睡眠期间发生的胃酸反流可能将严重负面影响病人休息。疾病后期可能将发生食管狭窄、食管瘢痕，导致排便梗阻、咀嚼困难。严重的食管炎病人可能将发生黏膜糜烂病变、黑便、贫血等。