中枢神经淋巴瘤严重，通常位于脑的深部且经常是多发性的；但诊断时仍须与多发性硬化、结节病及某些脑胶质瘤鉴别。脑淋巴瘤诊断的确立须依靠病理学而非单一影像学诊断。确诊脑淋巴瘤依赖于病理组织学诊断、主要通过立体定向肿瘤病灶穿刺活检获得。若肿瘤病灶原发于眼部或脑脊液（CSF）累及。