肛周脓肿的手术费用不高，在600-1000元之间，但是总体治疗的费用加起来大概需要5000-6000元左右。因为脓肿属于炎症感染性的疾病，所以在做手术之前以及在做手术之后，需要输入抗生素进行对症治疗，对伤口内部的细菌进行杀灭。在手术之前也需要常规做检查，比如血常规、生化、凝血、心电图。