甲胎蛋白偏高的原因有很多，比如妊娠妇女和新生儿都会出现甲胎蛋白的一时性的升高，原发性肝癌会导致甲胎蛋白的异常性升高。但是也不能仅仅单凭该项指标升高就确诊一定得了肝癌。其他的恶性肿瘤如睾丸癌、畸胎癌、胃癌、胰腺癌等也可以引起升高。有些肝炎、肝硬化的患者该项指标也是升高的。