婴儿做核磁共振打镇静剂不会对婴儿有危害。因为镇静剂是规定了一定的剂量的，不会对人体有伤害的。镇静剂具有镇静，催眠，麻醉等作用，可以缓解精神紧张，不会影响大脑的正常活动，只有在过量服用或者长期服用的情况下会造成成瘾和中毒等副作用。核磁共振是是一种使用磁场及射频脉冲进行的特殊检查，没有辐射，没有任务副作用。核磁共振前打镇静剂是为了保证检查的过程小孩的安全和平稳，作用温和，没有明显后遗症，而且剂量很小，不会产生依赖性。而且镇静剂这类的药物，在人体中能很快地代谢，不会在体内残留。如果之后出现恶心呕吐，食欲不佳等不良反应，应及时咨询医生。为了使婴儿能顺利进行核磁共振的检查，在检查前2个小时内不要给小孩进食，以免服用镇静剂的时候呕吐。而且可以在检查之前让小孩自己疲惫睡着，就可以避免服用镇静剂了，在检查过程中，家长要在旁边陪同，以免检查过程中，小孩子突然醒来发生什么意外状况。