自闭症属于一种先天性脑功能发育障碍，并不是由教育和生活环境恶劣而诱发的疾病。目前孤独症的病发因素不明确，各种证据支持孤独症是多种生物学原因所致的一种神经精神发育障碍，因此目前认为遗传的因素应该是其主要原因，病毒感染、免疫系统缺陷、神经系统疾病以及母孕期不良原因也起到了部分功效，其结果是造成脑结构神经传导不正常及脑组织改变，导致脑功能受损。