孩子半夜咳嗽多数情况下是由于炎症刺激引起的，其中以支原体感染最为常见，有必要到医院进行支原体抗体的检查，如果这项检查结果是阳性，需要使用抗生素抗感染治疗的时间最起码应该是2到3个周，即便孩子没有任何临床症状也需要按疗程用药。