细菌感染是致病菌或条件致病菌侵入血循环中生长繁殖，产生毒素和其他代谢产物所引起的急性全身性感染。肛肠科常见的细菌感染性疾病有肛周脓肿、肛瘘等。这些疾病会引起局部的红、肿、热、痛等症状，可采取手术切开引流治疗。