手足口病由肠道病毒感染引起，肠道病毒有多种，引起手足口病重症病例的，大多由肠道病毒71型引起。手足口疫苗指的就是预防肠道病毒71型感染的肠道病毒71型灭活疫苗，手足口病疫苗只能预防肠道病毒71型引起的手足口病，不能预防其他肠道病毒感染引起的手足口病，打完疫苗后还有可能感染手足口病。