子午流注在中医上是很有玄妙的，它可以治疗阴气不足，脾胃虚弱失调，然后肝气郁结，肺火旺盛，肾虚两亏等。按照中医解释认为人体功能活动、病理变化受自然界气候变化、时日等影响而呈现一定的规律。根据这种规律，选择适当时间治疗疾病，可以获得较佳疗效。