肚子里的胚胎不发育的病因可能就是因为肚子的胎儿这体本身发生不正常，或者是肚子里的胚胎有不正常，因为如果母亲身体上患有比较严重性的疾病，也会造成肚子的胎儿停止发育，建议在怀上孩子的时候，母亲要避免精神状态的过度紧张和焦虑，还有少接触烟酒一类的东西，以免对身体造成不佳的刺激。

胚胎发育不良那很可能是在怀孕早期孕酮的水平低导致的，这段时间不能劳累，需要积极休息，建议看一下分泌物的变化也不要进行剧烈活动，建议应该积极预约流产，下次怀孕前建议做内分泌和染色体的筛查，不能有大的压力，流产后不要过早的有性生活的。