不严重，只要不耐药，是可以治疗好的，一般治疗：加强护理,注意多休息,保持室内空气新鲜,给予热量丰富,富含维生素,易于消化吸收的食物,注意补充足够的水分.抗生素治疗：衣原体感染应首选大环内酯类抗生素,如红霉素,克拉霉素,阿奇霉素.也可选用多西环素。

根据所描述情况来看，十一岁孩子有高热表现，后一直咳嗽，检查诊断为衣原体肺炎，这是由衣原体引起的肺炎，衣原体分为沙眼衣原体、肺炎衣原体鹦鹉热衣原体。肺炎衣原体肺炎多见于学龄儿童，大部分为轻症，发病常隐匿。感染率没有性别差异，四季均可发生。这种疾病治疗时间较长，要坚持治疗，防止并发症发生。