卵巢内胚层窦瘤生长迅速，易发生囊膜破裂和腹膜内植入。常见症状有腹部肿块、腹胀、腹痛和腹腔积液。肿瘤坏死和出血可增加体温并引起发热。少数患者因胸腔积液仍屏住呼吸，但胸腔积液并不意味着胸腔转移。一些在手术后10到14天消失了。短期闭经或罕见月经患者卵巢功能正常。