引起咳嗽，发烧的常见原因就是病毒，真菌，细菌感染呼吸道所致，常见的疾病有：急性上呼吸道感染，急性支气管炎，肺炎，肺结核，胸膜炎，胸腔积液，支气管扩张，肺脓肿等。具体原因需要去医院进一步检查，建议抽血查血常规，支原体，衣原体，血沉，C反应蛋白，感染四项，胸片等检查明确病因，然后对症给予抗感染，抗病毒，清热解毒，退热，止咳化痰，抗炎等治疗，平时要注意保暖，多喝水，避免受凉。