宝宝发烧39度可以给予温水擦浴或者酒精擦浴物理降温治疗，同时也需要服用退热药物对症治疗，因为体温39摄氏度输液高热，容易引起寒颤，抽搐等并发症，需要及时处理。引起高热的原因一般是各种病毒，真菌，细菌感染所致，可以去医院进一步检查明确病因，抽血查血常规，血沉，C反应蛋白等检查，如果合并咳嗽，咳痰还需要查胸片或者CT明确，如果合并腹泻，恶心，呕吐，还可以查大便检查，然后对症治疗。