如果新生儿出生40天仍然存在黄疸的问题，考虑可能存在病理性黄疸的可能，生理性的黄疸一般在新生儿出生以后3~5天就会出现，可能会在5~7天内达到高峰，一般在14天内患者的黄疸会逐渐消退的，也不需要进行特殊的处理，但是如果新生儿的巩膜和皮肤持续出现黄疸，考虑可能是存在病理性黄疸的，建议查找导致病理性黄疸的原因，可以在医生的指导下适当的使用药物或者是照射蓝光来进行治疗。

出现新生儿的皮肤黄疸，而且40天没有退，可能会有两种可能性，如果是生理性黄疸，需要留意一下有没有是因为母乳性的黄疸，而且黄疸值不是很高，可以考虑停止母乳，口服益生菌控制黄疸。如果是病理性的黄疸，黄疸值升高比较多，也可能是生理性的黄疸。如果是病理性的黄疸，需要完善相关检查，看看是否因为肝胆方面的原因引起的，如果是胆囊堵塞引起的黄疸，可能需要手术治疗。